转基因小鼠外源基因鉴定方法
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2.5.5.1 小鼠尾巴DNA萃取方法
小鼠尾巴组织是获取小鼠DNA的主要来源,同时为了能对小鼠进行逐一辨认,常使用剪小鼠脚趾的办法进行编号。具体操作步骤如下:
1. 取断乳期(生后2~3周)乳鼠,无菌减去鼠尾约3mm,放入1.5mL离心管中并进行标记。
2. 手术器械每次操作使用不同器械,并用酒精棉球擦拭灼烧后使用。
3. 对乳鼠进行编号,以后方便随后检测结果对应及查找。
4. 具体DNA萃取步骤如下:
(1) 在离心管中加入350µL鼠尾组织缓冲液和35µL蛋白酶K,55℃孵育并振荡混匀过夜。
(2) 离心,转移上清液至新管并加入等体积的饱和酚抽提上清液。
(3) 加入等体积的酚:氯仿:异丙醇(25:24:1)(V/V/V),抽提上清液。
(4) 加入等体积的氯仿:异丙醇(24:1)(V/V)抽提上清液。
(5) 加入0.4倍体积(约154µL)DNA沉淀溶液,混匀后放置冰上2h,或4℃过夜。
(6) 室温离心6 min,弃上清液。
(7) 加入1 mL 70%乙醇,轻轻颠倒离心管几次,室温离心2 min,立即弃上清液,可见沉淀的DNA。重复本步骤一次。
(8) 干燥30 min后,加入100µL的TE缓冲液混匀。取5µL测OD260值。
2.5.5.2 PCR检测方法
PCR(聚合酶链反应)是一种在体外复制DNA分子的技术。通过PCR检测可以检测到转基因DNA的存在,具体操作步骤如下:
1. 确定PCR产物的大小范围,常扩增200~1,000 bp的靶序列即可。
2. 设计和制备合适的引物,引物一般可以设计两对进行扩增。
3. 对照设定,取1~2 pg的质粒DNA作为阳性对照,同时还需要做阴性对照,以检测测试剂或材料是否污染。
2.5.5.3 Southern Blot检测方法
当PCR方法无法确定转基因阳性时,可以采用Southern Blot检测方法。通常用基因组Southern blot来筛选founder小鼠和大鼠,以建立稳定的遗传品系。但如果要从插入转基因的杂合品系中分出纯合品系,则不能使用本方法。
具体操作方法如下:
1. 琼脂糖凝胶电泳:消耗5倍质量的限制性内切酶对5~10µg鼠尾基因组进行消化,并使用琼脂糖凝胶电泳分离各个酶解DNA片段。
2. 硝酸纤维素薄膜转印:使用变性缓冲液和中和缓冲液对琼脂糖凝胶
北检院部分仪器展示