信息概要

细胞血管形成表观遗传实验专注于研究血管生成过程中的表观遗传调控机制，包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA表达等变化。检测的重要性在于揭示血管疾病、癌症血管生成和发育异常的分子基础，为疾病诊断、治疗策略开发和个性化医疗提供科学依据。本服务提供全面、准确的表观遗传检测方案，确保数据可靠性和临床应用价值。

检测项目

DNA甲基化水平, 组蛋白H3K4me3修饰, 组蛋白H3K27me3修饰, 染色质可及性, DNA羟甲基化水平, 组蛋白乙酰化水平, 组蛋白磷酸化水平, 组蛋白泛素化水平, 非编码RNA表达谱, microRNA表达量, lncRNA表达量, circRNA表达量, DNA甲基转移酶活性, 组蛋白去甲基酶活性, 染色质重塑复合物活性, 基因启动子甲基化状态, 基因体甲基化状态, CpG岛甲基化状态, 增强子甲基化状态, 绝缘子甲基化状态, 组蛋白修饰芯片分析, ChIP-seq数据分析, ATAC-seq数据分析, RNA-seq数据分析, 甲基化特异性PCR, 亚硫酸氢盐测序, 全基因组甲基化测序, 靶向甲基化测序, 单细胞表观遗传分析, 空间表观遗传分析

检测范围

内皮细胞, 平滑肌细胞, 周细胞, 血管内皮祖细胞, 肿瘤血管内皮细胞, 正常血管组织, 动脉血管, 静脉血管, 毛细血管, 淋巴管, 血管瘤组织, 缺血组织, 再生血管组织, 发育中血管, 成年血管, 老年血管, 高血压模型血管, 糖尿病模型血管, 癌症模型血管, 炎症模型血管, 缺氧模型血管, 高脂血症模型血管, 动脉粥样硬化模型, 血管生成因子刺激细胞, 血管抑制因子处理细胞, 转基因动物血管组织, 人类患者样本, 细胞系模型, 原代细胞培养, 器官oid模型

检测方法

亚硫酸氢盐测序：用于全基因组或靶向DNA甲基化分析的高通量测序方法，提供单碱基分辨率数据。

染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）：通过抗体富集特定组蛋白修饰或转录因子结合的DNA区域，进行高通量测序分析。

ATAC-seq：利用转座酶探测染色质可及性，识别开放染色质区域和调控元件。

RNA-seq：通过测序分析全转录组表达水平，包括编码和非编码RNA，揭示基因表达变化。

甲基化特异性PCR（MSP）：使用引物特异性扩增甲基化或未甲基化DNA序列，用于快速检测特定区域甲基化状态。

全基因组甲基化测序（WGBS）：提供全基因组范围内的单碱基甲基化图谱，适用于 comprehensive 表观遗传研究。

靶向甲基化测序：针对特定基因或区域进行深度甲基化分析，提高检测灵敏度和特异性。

单细胞ATAC-seq：在单细胞水平评估染色质可及性异质性，用于研究细胞群体多样性。

单细胞RNA-seq：分析单个细胞的基因表达谱，揭示细胞异质性和功能状态。

Hi-C测序：研究染色质三维结构和基因组 architecture，帮助理解远程调控相互作用。

DNase-seq：通过DNase I酶切鉴定基因组范围内的开放染色质位点，用于评估染色质 accessibility。

MNase-seq：用于核小体定位和染色质结构分析，通过微球菌核酸酶处理测序。

MeDIP-seq：使用抗体富集甲基化DNA后进行测序，适用于全基因组甲基化 profiling。

hMeDIP-seq：特异性检测5-羟甲基胞嘧啶修饰，用于研究DNA羟甲基化变化。

Cut&Tag：高效 mapping protein-DNA interactions with low input，通过靶向切割和测序分析蛋白结合位点。

检测仪器

高通量测序仪, 实时荧光定量PCR仪, 显微镜, 流式细胞仪, 高效液相色谱仪, 质谱仪, 紫外可见分光光度计, 离心机, 电泳仪, 凝胶成像系统, 细胞培养箱, 生物分析仪, 核酸提取仪, 微阵列扫描仪, 单细胞分离系统

荣誉资质

北检院部分仪器展示