五指山猪近交系SLA-Ⅱ等位基因的PCR-SSCP检测

(一)材料和方法

本实验采用了60头五指山猪(WZSP)近交系,样本来自于中国农业科学院畜牧研究所试验猪场,采集猪耳组织样本并进行冷冻保存。

首先,按照标准的方法提取猪耳组织基因组DNA,并进行DNA浓度和纯度的检测和琼脂糖凝胶电泳检测。接下来,采用PCR技术扩增SLA-Ⅱ DRA、DRB、DQA、DQB基因的第二外显子,并使用SSCP检测进行突变位点的筛查。在筛选出的产物中,使用直接测序法(DS)进行测序,并利用DNAstar软件拼接序列,进行相似度检测,确定突变位点的碱基类型。

此外,本实验还采用MEGA3软件进行ClualW比对和NJ(邻接法)系统树构建,以检测系统树的可靠性。同时,利用BLAST将所得序列与GeneBank数据库中已有序列进行比较,进行同源性序列比较。

(二)SLA-DRA、DRB基因的多态性研究结果与分析

从PCR扩增结果中可以看出,SLA-DRA-Exon2和SLA-DRB

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