结肠小袋纤毛虫是一种世界性分布的疾病，散发较为常见。虽然在实验室灵长类动物中较为普遍，但这种寄生虫也会感染大鼠、猪、狗等动物。有研究表明，艾滋病患者也可能并发结肠小袋纤毛虫病。杨月等人研究发现，当人体免疫力低下时，感染结肠小袋纤毛虫会具有致病性。曲莉芝等人利用免疫抑制方法对大鼠进行结肠小袋纤毛虫病的研究，认为大鼠是否发病与免疫功能直接相关。
目前，通过灌胃的方式将结肠小袋纤毛虫输入大鼠体内来进行研究是一种模拟人类结肠小袋纤毛虫感染的方法。这种方法可以模拟出大鼠感染结肠小袋纤毛虫的临床表现，如腹泻、黏液等。同时，在进行模拟时，可以在大鼠饮水中加入地塞米松、四环素和食用白糖，以使得大鼠更容易感染结肠小袋纤毛虫。
需要指出的是，大鼠对结肠小袋纤毛虫的感染有着一定的抵抗力，因此在模拟病情时需要使用免疫抑制的方法来诱发大鼠感染。尽管如此，由于大鼠个体之间存在差异，有些大鼠可能会发病并致死，因此在造模时需要适当考虑用于造模的大鼠数量。
该模型动物肠溃疡的组织病理学变化与人类阿米巴感染后所引起的溃疡非常相似。该模型动物的临床表现也与阿米巴痢疾相似，可通过检查结肠小袋纤毛虫和阿米巴的包囊或滋养体予以区别。因此，该模型可用于对结肠小袋纤毛虫致病性等方面的研究。
